Sân bay

Sân bay Yonaguni

• Japan Transocean Air (JTA) – JAL
  • Sân bay Ishigaki 30 phút, một chuyến khứ hồi hàng ngày bằng (Boeing 737-400)
• Ryūkyū Air Commuter (RAC)
  • Sân bay Naha 80 phút, bốn chuyến khứ hồi mỗi tuần bằng (Bombardier Dash 8 DHC-8-100)
  • Sân bay Ishigaki 30 phút, bốn chuyến khứ hồi mỗi tuần bằng (Bombardier Dash 8 DHC-8-100)

Cảng

Cảng Kubura

• Tàu Fukuyama "Ferry Yonakuni"
  • Cảng Ishigaki 4h30'. (chỉ hai chuyến khứ hồi mỗi tuần)
  • Cảng Naha (lịch trình không đều)

Đường

• Tỉnh lộ Okinawa 216 – Tuyến đảo Yonaguni
• Tỉnh lộ Okinawa 217 – Tuyến cảng Yonaguni

Bus

• Yonaguni Transit